Ciri-ciri tegas, morfologi, filogeni dan klasifikasi



Firmicutes Ia adalah salah satu pinggiran yang mana diklasifikasikan oleh Bakteria. Filum ini terdiri daripada tiga kelas (Bacilli, Clostridia dan Erysipelotrichia), 26 keluarga dan 223 genera, dengan itu merupakan filum bakteria utama.

Bakteria yang dikelaskan dalam filum ini mempunyai sejarah evolusi biasa. Semua mempunyai dinding sel tegar, dari mana nama Firmicutes berasal (dalam bahasa Latin firmus  bermaksud firma dan kulit rujuk kepada kulit atau dinding sel). 

Semua bakteria pinggir mengandungi asid murámico di dinding sel dan ada yang mengandungi asid asiat. Majoriti gram positif, kecuali keluarga Veillonellaceae dan Syntrophomonadaceae, yang gram-negatif.

bakteria Firmicutes adalah phenotypically berbeza dan boleh menjadi sel-sel bulat, lurus, melengkung, rod heliks atau filamen, dengan atau tanpa flagella, dengan atau tanpa endospora tahan haba.

Mereka boleh menjadi anaerobes aerobik, fakultatif atau ketat. Ada yang termophilic dan / atau halophilic. Sesetengahnya adalah chemoganotrophs dan fotoheterotroph anoksik yang lain. Kebanyakannya tumbuh pada pH neutral, tetapi ada yang asidofilik atau alkalofilik. Mereka mempunyai kandungan DNA yang umumnya kurang daripada 50%.

Bakteria yang diklasifikasikan dalam filum Firmicutes membentuk bahagian penting dari flora usus manusia, bersama dengan yang diklasifikasikan dalam Bakteriodetum filum. Kajian baru-baru ini telah mengenal pasti bahawa mikrobiota usus manusia dan model haiwan gemuk dikaitkan dengan kelebihan Firmicutes yang berlimpah, berhubung dengan Bakteriodetes.

Indeks

  • 1 Ciri umum
    • 1.1 Phylogeny
  • 2 Klasifikasi
    • 2.1 Kelas Clostridia
    • 2.2 Kelas Erysipelotrichia
    • 2.3 Basilli Class
  • 3 mikrobiota gastrointestinal
  • 4 Rujukan 

Ciri umum

Phylogeny

Phylogeny dari Firmicutes telah sentiasa disemak semula dan diperiksa semula, memasukkan lebih banyak data dan kaedah baru yang membolehkan kita mencadangkan hipotesis evolusi baru.

Kajian baru-baru berdasarkan analisis subunit kecil urutan nukleotida RNA ribosom, menjana rangka kerja filogenetik di mana filum Firmicutes itu terdiri daripada tiga kelas (Basilli, Clostridia dan erysipelotrichia), 26 keluarga dan 223 genera.

Dalam klasifikasi sebelum, kelebihan ini termasuk kelas tambahan yang dipanggil Mollicutes, yang berbeza daripada bakteria lain Firmicutes dalam kekurangan dinding sel tegar, peptidoglycan atau tanpa asid muramic, mereka adalah fleksibel dan adalah sel-sel yang sangat pleomorphic.

Kumpulan ini telah dikeluarkan dari Firmicutes dalam kajian yang lebih baru dengan penanda alternatif. Akibatnya, kelas Mollicutes dinaikkan ke tepi Tenericute.

Keluarga Erysipelotrichaceae, sebelum ini diklasifikasikan dalam Mollicutes, gram-positif dinding sel membentuk, kekal Firmicutes sebagai kelas baru yang dikenali sebagai erysipelotrichia, dengan satu perintah (Erysipelotrichales) termasuk sebuah keluarga (Erysipelotrichaceae). analisis baru-baru ini mengesahkan pemisahan antara kelas Basilli dan Clostridia.

Pengkelasan

Kelas Clostridia

Kelas Clostridia adalah clade polyphiletic fenotip, fisiologi dan ekologi. Ia mengandungi kedua-dua bakteria gram-positif dan gram-negatif dan kebanyakan genera spora-membentuk, dengan pengecualian seperti Clostridium.

kelas Clostridia terdiri daripada Clostridiales, halanaerobiales, dan perintah Thermoanaerobacterales. Bakteria yang dimiliki oleh perintah itu Clostridial anaerobes ketat adalah halanaerobiales penguatkuasaan adalah halophilic dan perintah itu adalah thermoanaerobacteriales thermophilic.

Sesetengah spesies Clostridia sangat penting untuk industri ini, yang digunakan untuk menghasilkan pelarut sebagai produk akhir proses penapaian. 

Yang lain menghasilkan toksin, seperti Clostridium botulinum, juga dikenali sebagai BoTox, untuk melumpuhkan otot-otot muka untuk mengurangkan kerutan kulit.

Kelas Erysipelotrichia

Kelas ini terdiri daripada bakteria dalam bentuk batang tipis nipis, lurus atau sedikit melengkung, dengan kecenderungan untuk membentuk filamen panjang. Mereka tidak bergerak, dengan dinding sel positif gram, yang tidak menghasilkan endospora.

Mereka adalah aerobik, anaerobik fakultatif. Mereka adalah chemoorganotrophic. Mereka mempunyai metabolisme pernafasan fermentatif. Kumpulan ini termasuk beberapa spesies patogen untuk mamalia dan burung, di antaranya Erysipelothrix rhusiopathiae dan Bulleidia extrude.

Kelas Basilli

Bakteria kelas Basilli biasanya membentuk dinding sel positif gram. Mereka mungkin atau mungkin tidak membentuk endospora. Kebanyakannya adalah aerobik atau mikroaerofilik, sementara hanya beberapa yang anaerobal fakultatif. Kelas Bacilli terdiri daripada pesanan Bacillales dan Lactobacillales.

Kebanyakan genera bentuk Bacillales membentuk endospora, walaupun ada pengecualian. Di samping itu, mereka mempunyai pewarnaan gram positif dinding sel dalam sel muda. Kebanyakan jantina mempunyai menaquinone 7 (MK-7).

Menaquinones rantai panjang, dari MK-6 hingga MK-11 telah dilaporkan dalam keluarga thermoactinomycetaceous. Menaquinones juga dikenali sebagai vitamin K2. 

Bilangan rantaian sampingan ditunjukkan dalam nama tertentu setiap menaquinone (mis. MK-6 mempunyai enam unit molekul yang melekat pada nukleus molekul yang dibentuk oleh cincin quinone).

Bacillales genus termasuk bakteria yang sangat patogen seperti Bacillus anthracis, menyebabkan antraks. Satu lagi spesies penting ialah Bacillus subtilis, salah satu daripada organisma yang digunakan sebagai model dalam penyelidikan untuk memahami topik-topik yang terdiri daripada pembezaan sel ke penyimpanan besi dan replikasi DNA.

Bakteria daripada Lactobacillales perintah boleh mempunyai rod atau coccus, pewarnaan Gram-positif mempunyai dinding sel, tidak membentuk endospora dan anaerobik fakultatif dan catalase negatif kebanyakannya.

Pesanan ini termasuk bakteria berfaedah seperti Lactobacillus, komponen penting dalam flora gastrointestinal pada manusia dan haiwan lain, dan digunakan secara artisanal dan industri untuk menghasilkan yogurt dan makanan lain yang ditapai.

Mikrobiota gastrousus

Mikrobiota gastrousus memainkan peranan penting dalam mengekalkan kesihatan manusia dengan menyediakan perlindungan tenaga, nutrien dan imunologi. Pada orang dewasa yang sihat, lebih daripada 1250 spesies bakteria yang dimiliki terutamanya oleh Bacteroidetes, Firmicutes dan Actinobacteria telah dikenalpasti.

Secara umumnya, hubungan Firmicutes / Bacteroidetes dianggap sangat penting dalam komposisi microbiota usus manusia. Di kalangan orang gemuk, sebahagian besar Firmicutes telah dikenalpasti, manakala pada mereka yang mempunyai berat badan rendah hubungan songsang telah dilaporkan.

Komposisi microbiota ini berkembang sepanjang hayat, dari zaman kanak-kanak hingga usia tua. Oleh itu, hubungan Firmicutes / Bacteroidetes mengalami peningkatan dari kelahiran hingga dewasa dan diubah lagi dengan usia lanjut.

Ia juga telah dikenal pasti bahawa diet mempunyai kesan penting pada mikrobiota gastrousus. Nisbah Firmicutes / Bacteroidetes lebih tinggi pada orang-orang dengan diet berdasarkan protein haiwan dan lemak tepu daripada mereka yang mempunyai diet tinggi dalam tumbuhan dan serat.

Rujukan

  1. Bahl, H & Dürre, P. (2000). Clostridia: Aplikasi Bioteknologi & Perubatan. Jerman Wiley-VCH.
  2. Conlon, M.A. & dan burung. A.R. (2015). Kesan Diet dan Gaya Hidup pada Gut Microbiota dan Kesihatan Manusia. Remaja, 7 (1), 17-44.
  3. Firmicutes. (2018, 30 Januari). Wikipedia, ensiklopedia percuma. Tarikh perundingan: 20:40, 27 September 2018 dari en.wikipedia.org
  4. Firmicutes. (2018, 17 September) Di Malaysia Wikipedia, Ensiklopedia Percuma. Diperolehi 20:41, 27 September 2018, dari en.wikipedia.org
  5. Mariat, D, Firmesse, O., Levenez, F, Guimarães, VD, Sokol, H, Doré, J, Corthier, G dan Furet JP. (2009). Nisbah Firmicutes / Bacteroidetes perubahan mikrobota manusia dengan usia. BMC Microbiology, 9: 123.
  6. Vos, P., Garrity, G., Jones, D., Krieg, N. R., Ludwig, W., Rainey, F. A., Schleifer, K.-H., Whitman, W. (2009). Manual Bergey Bacteriology Sistematik: Jilid 3: Firmicutes. Amerika Syarikat.